Misi adalah rumusan umum mengenai upaya – upaya yang akan dilaksanakan untuk mewujudkan Visi. Misi berfungsi mempersatu gerak,langkah dan tindakan nyata bagi segenap komponen penyelenggara pemerintahan Desa tanpa mengabaikan mandat yang diberikan.

Adapun Misi Pemerintahan Desa Pacarpeluk Adalah sebagai berikut:

1.      Mewujudkan Pemerintahan yang baik

Mengandung arti penyempurnaan struktur kelembagaan pemerintahan Desa yang menitikberatkan pada proses penguwatan  kelembagaan /Organisasi agar dapat menjalankan fungsi-fungsi yang diamanatkan dalam peraturan Perundang-undangan untuk mewujudkan Pemerintahan Desa yang profesional, efektif, berkopetensi tinggi terhadap tugas pokok dan fungsinya dalam pelayanan Masyarakat Desa.

2.      Meningkatkan Kualitas Hidup Masyarakat

           Mengandung arti mengupayakan  partisipasi seluruh Komponen Masyarakat, Pemerintah Desa, Lembaga Desa dan swasta agar pembangunan di Desa Pacarpeluk Kecamatan Megaluh Kabupaten Jombang mampu menghasilkan sumberdaya manusia yang berkwalitas tinggi, mempunyai integrasi dan jatidiri yang dipandu oleh nilai-nilai yang luhur berbudaya dan beragama.

3.      Membangun Struktur Perekonomian yang Kokoh berbasis Keunggulan dibidang Agribisnis

Mengandung arti mengembangkan Desa dengan memperkuat perekonomian Desa yang mengandalkan pada kekuatan sektor pertanian dan Produk Unggulan Desa menuju keunggulan Kompetitif dengan membangun keterkaitan produksi, distribusi dan pelayanan, mengurangi kesenjangan sosial secara menyeluruh, menumbuhkan pada perekonomian kerakyatan serta mengutamakan program program penangulangan kemiskinan.

4.      Mewujutkan Pembangunan yang Berkelanjutan

 Mengandung arti pembangunan yang dilaksanakan tidak semata untuk mengejar pertumbuhan,namun bagaimana pertumbuhan yang ada dapat dirasakan secara merata dari hasilnya oleh semua masyarakat dengan tetap mempertimbangkan faktor alam dan lingkungan sekitarnya.